假基因,没有功能的基因,在进化和比较基因组的研究中有重要的意义,因为它们提供了几百万年前基因的一些信息,因而被称为基因组的化石。耶鲁大学的Zhaoli Zhang等人发表了他们近期的研究。
他们系统研究了约5000小鼠基因组中的假基因,发现其中有约60%是在小鼠和人产生之后才产生的。在人和小鼠的基因组中,很多假基因的类型有共同的规律,它们多是在体内高效表达的“看家基因”(housekeeping gene),如核糖体蛋白基因。他们还发现,小鼠中的假基因在染色体上的分布与LINEs或SINEs不同,他们多分布在低GC含量的区域内。而人的假基因多分布在染色体的中等GC含量区域。另外,在假基因的“年龄”上,小鼠的假基因的年龄与LINEs类似,而人的与Alus (SINEs)类似。
科学家们期待着大鼠(rat)的基因组的测序完成,这样它们能在小鼠(mouse),大鼠及人这三种基因组的比较上得到更多的结论。
参考文献:
Zhaolei Zhang, Nick Carriero and Mark Gerstein. (2004) Comparative analysis of processed pseudogenes in the mouse and human genomes. Trends in Genetics, 20:2:62-67. doi:10.1016/j.tig.2003.12.005