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游动支原体(Mycoplasma mobile)的全基因组

作者:佚名?来源:不详?发布时间:2007-7-26 0:09:52

虽然支原体常被称为是最小的生物,它却在宿主环境、表型特征、病源性上有很大的区别。这篇文章报道了鱼的一种支原体游动支原体(Mycoplasma mobile)的全基因组。这种支原体具有超强的游动性。这种基因组的注释第一次把许多蛋白质的表达信息整合进来。

  这种基因组具有一些奇特的特点,比方说,一个2435 bp的片断被重复了5次,它编码几乎一致,但表达奇特的蛋白质。

  Mycoplasma mobile具有已知最低的GC含量(24.9%),也具有已知最少的tRNAs数(28个)。它的基因组中存在大量的随机重复(tandem duplication ),以及基因水平转移现象。

  把一些游动和不游动的支原体进行比较基因组分析,发现了一些可能和游动特性相关的基因。

参考文献:
The Complete Genome and Proteome of Mycoplasma mobile
     Jacob D. Jaffe, Nicole Stange-Thomann, Cherylyn Smith, David DeCaprio,
     Sheila Fisher, Jonathan Butler, Sarah Calvo, Tim Elkins, Michael G.
     FitzGerald, Nabil Hafez, Chinnappa D. Kodira, John Major, Shunguang
     Wang, Jane Wilkinson, Robert Nicol, Chad Nusbaum, Bruce Birren, Howard
     C. Berg, and George M. Church
     Genome Res. 2004;14 1447-1461
    
http://www.genome.org/cgi/content/abstract/14/8/1447?etoc

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