单纯认识单个基因只能盲人摸象的了解生命,基因有自身的结构功能,表达调控,基因与基因,蛋白与蛋白之间又有着错综复杂的关系。可喜的是,大批量基因或蛋白相互作用的研究已经逐渐进入到几种模式生物。
已经有一些无脊椎动物的蛋白互作图得到研究,但至今还没有一种哺乳动物的相关研究发表。这篇文章便第一个对人的蛋白互作进行了大规模的研究。
在低等真核生物中,酵母、线虫、果蝇的蛋白互作已经得到很多研究。这些相互作用有的来源于实验,如酵母双杂交系统数据,有的来源于生物信息学分析。这篇文章通过这几种真核生物与人的ortholog(直向同源基因)进行研究,把几种低等真核生物的蛋白互作关系转移到人中,得到总数为约7万个蛋白相互作用关系。然后他们根据这些相互关系的准确度或可信度,对这些相互作用关系进行了分类。
蛋白相互作用关系的草图的得到,有利于人们进一步研究未知基因的功能,以及帮助人们全面的了解生命体。
(此篇文章及相关分析结果全部可以在网上免费得到)
直向同源基因指的是来源于同一祖先,具有类似生物学功能的基因。
参考文献:
Ben Lehner and Andrew G Fraser.
Address: The Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge CB10 1SA, UK.
A first-draft human protein-interaction map.
Genome Biology 2004, 5:R63, Published: 13 August 2004.
http://genomebiology.com/2004/5/9/R63