脊椎动物基因组中的“沙漠”

  在基因组中，存在大片段的不编码蛋白质的区域，这样的区域称为“基因沙漠”。随着基因组研究的深入，基因组中非编码区域的研究逐渐多起来。这篇文章便是其中的一例。

  这篇文章发表在近期的“Genome Research”（《基因组研究》）上，它把人和鸡的基因沙漠进行比较，利用保守性将人的基因沙漠分为两类：稳定型和可变型。它们之间的区别并不是中性进化（neutral evolution）的区别，而是功能上的差别。稳定型基因沙漠的周围多是与转录调控与发育相关的基因，而可变型基因沙漠的周围则是功能各异的基因。

  稳定型基因沙漠对于染色体的重排（rearrangements）有抑制作用，并且经常携带有远程调控元素，与它临近的基因相关。并且稳定型基因沙漠在脊椎动物基因组也是比较保守的。

参考文献：

Ovcharenko, I., Stubbs, L.
Evolution and functional classification of vertebrate gene deserts.
Genome Research Vol 0, Issue 2004, gr.3015505, 2004
http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.3015505