大家熟知的mRNA是编码蛋白质的RNA分子,而最近对真核生物基因组中的不编码蛋白却可以转录的区域的研究已经非常火热了,然而这些转录物缺少保守性的结构,却具有重要的生物学功能,这给研究带来很多争论。本研究用一种特殊的方法克隆到100个新的以及61个已知的线虫全长非编码RNA(full-length ncRNAs)。研究发现三分之二的这些非编码RNA,都是独立转录的,并且专一的受上游的启动子元件的调控。并且,60%的非编码RNA的转录水平都随分化的不同阶段而变化。同时,文中鉴定了两类新的非编码RNA:stem-bulge RNAs (sbRNAs)和snRNA-like RNAs(snlRNAs),它们都有鲜明的内部模体结构,二级结构,上游元件以及具有高水平的随发育变化的转录。
参考文献:
Wei Deng, Xiaopeng Zhu, Geir Skogerb, Yi Zhao, Zhuo Fu, Yudong Wang, Housheng He, Lun Cai, Hong Sun, Changning Liu, Biao Li, Baoyan Bai, Jie Wang, Dong Jia, Shiwei Sun, Hang He, Yan Cui, Yu Wang, Dongbo Bu and Runsheng Chen.
Organization of the Caenorhabditis elegans small non-coding transcriptome: Genomic features, biogenesis, and expression.
Genome Research 16:20-29, 2006
Published online before print December 12, 2005, 10.1101/gr.4139206
http://www.genome.org/cgi/content/abstract/16/1/20